Indlæser nu
×

Kromosom-browser

Inden vi ser på hvad en Kromosom-browser er for noget.

At gennemføre en DNA-test er blevet stadigt mere almindeligt, især når det gælder etnicitet, altså hvilke befolkningsgrupper ens DNA ligner mest. Det kan være underholdende, men det fortæller generelt ikke så meget om dig.

Det er mere interessant at se, hvem man har familierelationer til, altså hvem man deler DNA med. Har man en relation, har man også fælles forfædre og formødre.

Dit DNA består af både små og store stykker segmenter. Hvert DNA-stykke er arvet fra enten din mor eller far, som har arvet dem fra deres forældre osv. Det betyder, at alle dine DNA-stykker er en blanding af DNA fra dine fire bedsteforældre, som igen er opdelt i stykker fra dine otte oldeforældre. Denne opdeling bliver ved op til 10 – 15 generationer, hvorefter stykkerne er for små til at bestemme hvor de kommer fra.

Dit DNA består af 22 kromosompar og et kønskromosompar. Halvdelen af de 22 par stammer fra far, og den anden halvdel fra mor. Dit DNA består af en række basepar, hvor et enkelt par kaldes en SNP; den ene base stammer fra far, og den anden fra mor.

Segment

Kromosom-browser er et værktøj til at gennemse delte segmenter mellem dig og flere DNA-matches. Dette værktøj er en del af MyHeritage, Family Tree DNA eller andre, der tilbyder en DNA-test.

Et segmenter en del af en større helhed. Det vil sige, dele af dit DNA som du muligvis har tilfælles med et match. Segmentet kan være større eller mindre og indeholder typer af genetiske informationer. En række af SNPs kalder man et segment.

Når MyHeritage, Family Tree DNA eller andre tester dit DNA, så sammenlignes de forskellige segmenter med hinanden. Er to segmenter fra to personer lange nok og ens, så kan de to personer være i familie med hinanden og dele en fælles ane. 

Kromosom-browser

En kromosom-browser er et værktøj, der giver et visuelt overblik over, hvilke segmenter og hvor mange segmenter man deler med et match.

I MyHeritage findes kromosom-browseren to steder: under DNA-matches og under DNA-værktøjer.

DNA-match

Under DNA i menuen i Myheritage finder du alle dine matches. Hvert enkelt match har en knap ”Tjek DNA-match” hvor du kan se mulige Relationer, Fælles DNA-matches og andre informationer.

Et match hvor jeg deler 1,3 % med vedkommende. Jeg har af hensyn til personen fjernet navnet.

Under Tjek DNA-match finder man nederst Kromosomviser- fælles DNA-segmenter. Her får du et visuelt overblik over, hvor mange segmenter du deler med dit match, hvor mange SNPs de er, og hvor på dine 22 kromosomer de ligger (her er kønskromosomener ikke med). De farvede felter er fælles segmenter, de grå er hvor der ingen fælles DNA-segment er og de skraverede er der hvor der ikke er taget prøver.

Desto flere og længere segmenter du har tilfælles med et match, des tættere familierelation har I.

Klikkes der på segmentet på kromosom nr. 5 får man flere informationer. Start og slut placering, segmentstørrelsen i cM (Centimorgan) og antal SNP’er.

Kromosomviseren viser at jeg har 5 segmenter fælles med mit mach og at de ligger på kromosom 5,10, 13, 14 og 16. Den største ligger på nr. 10.

cM er en enhed til måling af DNA. Centimorgan, forkortet cM, er opkaldt efter Thomas Hunt Morgan, som var en amerikansk evolutionsbiolog og genetiker.

Størrelsen af cM er med til at afgøre relationen til andre. Groft sagt, jo højere cM, jo tættere relation, men så enkelt er det ikke. En genetisk afstand er ikke en fysisk afstand, men en sandsynlighed for en relation.

En tommelfingerregel er, at med et cM på over 15 så stiger sandsynligheden for en familierelation. Desuden vil en samlet procent over 0,4% være en mere sikker familierelation.

DNA-værktøjer

I forbindelse med, at man har taget en DNA-test hos MyHeritage, har man adgang til diverse DNA-værktøj. I menuen under DNA findes punktet DNA-værktøjer og herunder Kromosom-browser. Her er det muligt at se hvilke segmenter du har fælles med en og flere af dine matches.
Øverste til venstre optræder du selv eller den du vil testes op i mod. Nederst er alle DNA-matchene, sorteret efter hvor meget du er i familie med dem. Du kan vælge en og op til syv personer som du gerne vil sammenligne med. Ved at klikke på dine match vælger du dem du vil undersøge

Jeg optræder selv øverst til venstre og min match ses nederst. De er sorteret efter hvor meget fælles DNA vi deler

Eksemplet overfor viser, at jeg har valgt tre personer fra min matchliste. Hver har sin egen farve:  Person 1 har farven rød, person 2 farven orange og person 3 farven gul. Farverne viser de segmenter jeg har tilfælles med person 1, 2 og 3. I det viste eksempel er kromosom nr. 1 til 5 medtaget. I kromosom nr. 1 deler jeg segmenter med person 1 (rød) og person 2 (orange), men ikke med person 3 (gul).

Nederst på siden vises antallet af segmenter jeg deler med person 1, 2, og 3. Klikkes der på en af personerne vises det præcis hvor på kromosomerne de delte segmenter ligger. Desuden oplyses det, at vi ikke deler nogen trianguleret segment.

Triangulering og et eksempel

Det mest interessante værktøj i DNA-browseren er Triangulering.

Triangulering betyder, at du og mindst to andre personer deler samme segment eller segmenter og har dermed en fælles ane.  F.eks. hvis din farfar og farmor har yderligere to andre børnebørn, så vil du og dine to fætre eller kusiner være trianguleret med fælles segmenter fra jeres bedsteforældre.  

I eksemplet nedenfor deler jeg på kromosom nr. 4 fælles segment med person rød og person orange (den lille ramme).  Det betyder at vi har en fælles forfar et eller andet sted i vores slægtstræ.  Det viser sig, at segmentet vi deler er fra mine oldeforældre, gul og rødes tipoldeforældre. Hvilken af de to oldeforældre det stammer fra kan vi ikke se ud af det her.

På kromosom nr. 3 ligger rødt og gult samme sted, men uden en ring. Det betyder, at her er der ingen fælles segment. Grunden er, at de 22 kromosomer er i par, en fra mor og en fra far, og i dette tilfælde ligger de på hver sit kromosom på nr. 3 og er derfor ikke i familie sammen.

Øverste oplyses det i mit tilfælde, at der er to triangulerede segmenter. Nummer to ligger på kromosom nr. 13 og kan ikke ses her

Hvordan kan kromosom browser hjælpe med at identificere forbindelser.

Hvis man har et match uden et slægtstræ, kan det være svært at finde hvor man har fælles aner.  Start med at tjekke det ukendte match med kendte match på din mors side og din fars side.